AlphaFold: Prediksi Struktur Protein dengan AI untuk Riset Kesehatan

Bentuk tiga dimensi protein menentukan cara kerjanya, sehingga mengetahuinya penting untuk memahami penyakit dan merancang obat. Namun metode eksperimen membutuhkan waktu berbulan-bulan hingga bertahun-tahun untuk satu protein, sehingga hanya sebagian kecil protein yang strukturnya diketahui.

AlphaFold memakai jaringan saraf untuk memprediksi koordinat atom protein berdasarkan urutan asam amino dan pola evolusi dari protein terkait. Google DeepMind dan EMBL-EBI merilis hasilnya secara terbuka melalui AlphaFold Protein Structure Database, yang bisa dicari dan diunduh gratis.

AI berperan sebagai mesin prediksi: model pembelajaran mendalam menghasilkan struktur beserta skor keyakinan per residu, sehingga peneliti tahu bagian mana yang dapat dipercaya. Prediksi ini melengkapi, bukan menggantikan, penentuan struktur lewat eksperimen.

Basis data AlphaFold telah dipakai lebih dari tiga juta orang di lebih dari 190 negara. Pada uji CASP14, akurasi tulang punggung median AlphaFold mencapai 0,96 Å, jauh lebih baik daripada metode terbaik berikutnya.